12−2−1 削除（平19年課法2−3「三十二」により改正、平22年課法2−1「二十七」により削除）
12−2−2 法第62条の7第1項(同条第3項において読み替えて準用される場合を含む。以下12−2−3において同じ。)《特定資産に係る譲渡等損失額の損金不算入》に規定する「共同で事業を行うための適格組織再編成等」に該当するかどうかの判定に当たっては、1−6−4《従業者の範囲》から1−6−7《特定役員の範囲》までの取扱いを準用する。（平19年課法2−17「二十五」、平22年課法2−1「二十七」、平29年課法2−17「十二」により改正）
12−2−3 合併法人等(合併法人、分割承継法人、被現物出資法人又は被現物分配法人をいう。)が法第62条の7第1項《特定資産に係る譲渡等損失額の損金不算入》に規定する特定適格組織再編成等により支配関係法人(同項に規定する支配関係法人をいう。)において圧縮記帳の適用を受けた資産の移転を受けた場合において、当該資産が令第123条の8第3項第4号《特定引継資産から除かれる資産》に掲げる帳簿価額又は取得価額が1,000万円に満たない資産に該当するかどうかの判定を行うときは、当該資産に係る積立金の金額の引継ぎを受けたかどうかにかかわらず、当該固定資産の帳簿価額又は取得価額は、圧縮記帳に係る規定の適用を受けた後の金額になることに留意する。（平19年課法2−3「三十二」、平19年課法2−17「二十五」、平22年課法2−1「二十七」により改正）
12−2−4 連結法人がその有する資産の評価換えにより生じた損失の額について法第33条第2項《資産の評価損の損金算入》の規定の適用を受けている場合に、当該損失の額につき法第62条の7《特定資産に係る譲渡等損失額の損金不算入》の規定が適用されたときであっても、当該資産の帳簿価額は当該評価換え後の帳簿価額となることに留意する。
13−2−1《連結法人が他の連結グループに加入する場合の資産に係る時価評価》の場合において、法第61条の12第1項《連結納税への加入に伴う資産の時価評価損益》又は第62条の9第1項《非適格株式交換等に係る株式交換完全子法人等の有する資産の時価評価損益》の規定により損金の額に算入した評価損の金額につき法第62条の7の規定が適用された場合についても、同様とする。（平19年課法2−3「三十二」により改正）
12−2−5 令第123条の8第1項第2号及び同条第12項《特定資産に係る譲渡等損失額の損金不算入》の「最後に支配関係があることとなつた日」については、11−1−5の取扱いを準用する。(平22年課法2−1「二十七」により追加、平25年課法2−4「四」により改正)
12−2−6 令第123条の8第3項第4号《特定引継資産から除かれる資産》の取得価額については、6−8−4《形式基準による修繕費の判定》の(2)の(注)による。（平19年課法2−7「十」により追加、平22年課法2−1「二十七」により改正）
12−2−7 分割法人又は現物出資法人が分割承継法人又は被現物出資法人に対してその有する株式のみを移転する適格分割又は適格現物出資は、令第123条の9第9項《特定資産に係る譲渡等損失額の計算の特例》の「事業を移転しない適格分割若しくは適格現物出資」に該当する。(平22年課法2−1「二十七」により追加、平25年課法2−4「四」により改正)